07/05/2018 - No Comments!

별에서 온 그대 대본 다운로드

우리는 더-예측 fusions을 지 원하는 증거의 심도 있는 보기를 제공 합니다 fusionspector 라는 동반자 도구가 있습니다. fusionspector는 또한 드 노 보에 트리니티를 실행할 수 있는 확인 된 융합 지원 RNA-Seq 읽기를 기반으로 예상 융합 성적을 재구성. 성적 증명서에 액세스 하는 데 문제가 있는 경우 레지스트라 사무소에 문의 하십시오. ` 퓨전 코딩 효과 ` 모듈에 의해 위에서 설명한 재건 성적은 참조 주석과 참조 게놈 시퀀스를 기반으로 합니다. 당신은 실제 융합 지원 RNA-Seq 읽기를 기반으로 융합 성적표 드 노 보 재건을 하 고 관심이 있다면, 어떤 추가적인 변종 정보 또는 읽기 중 증거가 될 수 있습니다 소설을 시퀀스 기능을 캡처, 당신은 드 노 보를 포함 시킬 수 있습니다 스타 퓨전 `--denovo_reconstruct ` 매개 변수를 호출 하 여 재건. 이렇게 하려면 `--fusioninspector 검사 | validate ` 설정을 포함 해야 합니다. 별 융해에 기초를 두어 예언 된 fusions. 예를 들어 삼 위 일체 재건 융합 성적표: 만약 내가 내 레코드에 대 한 또 다른 복사본을 구하는 방법 제 별 보고서를 잃 었 어? 당신은 당신의 학문적 인 고문 관에 서 사본을 얻거나 오아시스에서 사본을 인쇄할 수 있다. fusionspector는 ` 검사 ` 또는 ` 검증 ` 모드에서 실행 될 수 있습니다 스타-퓨전에서 하류를 실행 하면: 개인 수 표 또는 미국 이외의 머니 오더는 허용 되지 않습니다.

서 부 동맹 우편환을 사용 하거나 정보 더를 위해 저희에 게 연락 하십시오. 사본은 wvu에 학생의 등록의 완전 한 기록 이다. 여기에는 모든 학부, 대학원 및 전문 코스가 포함 됩니다. 일부 사본은 사용할 수 없습니다. 또한 wvu는 고객에 게 다른 기관의 사본을 제공 하지 않습니다. ` splicetype `은 참조 스크립트 구조 주석 (예: gencode)에서 제공 되는 참조 exon 교차점에서 제안 된 중단점이 발생 하는지 여부를 나타냅니다. 비교적 긴 단일 엔드 읽기 (예: 최소 100 기본 길이)가 없는 경우에는 퓨전 성적 증명서를 감지 하기 위해 전력이 부족 합니다. 스타-퓨전은 트리니티 암 transcriptome 분석 툴킷 (ctat)의 구성 요소입니다.

별 융해는 별 alaligner를 사용 한다 illuminina 독서에 의해 지원 된 후보자 융해 사본을 확인 하기 위하여. 별 융해는 별 aligner에 의해 생성 된 출력을 더 처리 하 여 참조 주석 세트에 연결 읽기 및 스패닝 읽기를 매핑합니다. 환경 변수 ` CTAT_GENOME_LIB `을 `/path/to/your/ctat_genome_lib_build_dir `로 설정 하면 위의 빌드 프로세스 또는 플러그 앤 플레이 설치에서 발생 그럼 당신은 지정할 필요가 없습니다--genome_lib_dir 스타 퓨전 매개 변수로 . 포함 된 테스트/디렉토리에, 당신은 fastq의 작은 샘플을 찾을 거 야 종양 샘플에서 읽습니다. 다음과 같이 리소스 세트를 사용 하 여 융해를 찾는다: 학술 성적표를 선택 하 여 비공식 웹 사본을 볼 수 있습니다. 전직 학생과 졸업생은 자격 증명 솔루션을 통해 녹취 록을 주문할 수 있습니다. 삼위일체는 fusionspector에 의해 건설 된 융해 conggs에 맞추어진 독서를 조립 하기 위하여 이용 된다. 만약 fusion검사관 ` 검사 ` 모드, 다음에만 융합-증거가 읽기 드 노 보 조립입니다 호출 됩니다. fusioninspector ` 검증 ` 모드가 선택 된 경우, 융합 유전자 conggs에 정렬 된 모든 읽기가 조립 됩니다. 퓨전 성적표로 확인 된 트리니티 conggs가 캡처하고 보고 됩니다. 드 노 보 재건축 퓨전 성적표는 fasta 파일 ` $ {star_fusion_output_directory}/FusionInspector/finspector.gmap_trinity_GG.fusions.fasta `로 제공 되며, 기록 accessions는 fusion검사관 탭으로 구분 된에서 보고 됩니다 요약 출력 파일입니다.

Published by: jeshurun

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